Duffy cresceu em
Manchester, onde começou a tocar viola aos catorze anos de idade. Duffy começou sua carreira tocando em diferentes bandas punk de no final de 1970, mas estes anos anteriores foram mais notáveis por ter introduzido Johnny Marr (
The Smiths) para a guitarra e incentivando
Morrissey para fazer sua estreia cantando com Duffy, em
The Nosebleeds.
Quando o movimento punk rock inicial (liderada pelos
Sex Pistols) morreu, Duffy acabou por ficar como guitarrista dos
Theatre Of Hate. Finalmente encontrou
Ian Astbury (vocalista da banda
Southern Death Cult, de
gothic rock), que ficou impressionado com a perícia de Duffy e abandonou Southern Death Cult para iniciar uma nova banda com ele. Juntos, eles exploraram o sucesso do
Southern Death Cult, chamando-se
Death Cult. Após o alarde inicial e um par de singles, Duffy, após uma viagem a
Nova York, convenceu Astbury a encurtar o nome da banda para
The Cult, em 1984.
Duffy ajudou a mudar o som de
The Cult para metal-blues para seu terceiro álbum, "
Electric" de 1987, o crédito para que essa alteração fosse possível foi para o produtor e fã de
AC/DC,
Rick Rubin. Fresco ainda pelo seu trabalho de produção nos
Beastie Boys, no seu álbum de estreia "
Licensed to Ill", Rubin deu tanto a Duffy e ao grupo
The Cult uma nova direcção musical.
Duffy mudou-se para
Los Angeles em 1988, com Astbury, onde ambos permanecem. Lá, os dois parceiros de escrita (com o antigo baixista
Jamie Stewart) viraram-se para
stadium rock e gravaram "
Sonic Temple".
The Cult atingiu um público maior,
mainstream, mas a atenção do público não foi sustentada com o seu próximo álbum, "
Ceremony", no alvorecer da era
grunge.
Após a turnê
Cerimonial Stomp, de 1992, Astbury e Duffy foram pressionados para regressar às suas raízes, com "
The Cult". Este acabaria por levar à saída de
Ian Astbury, de Duffy e do grupo
The Cult, em 1995.
Durante a interrupção de
Cult durante quatro anos, Duffy tocou com Mike Peters,
The Alarm, num projecto chamado
Coloursound.
Duffy reformula
The Cult com Astbury, em 1999, que conduziu a um novo contrato de gravação com a
Atlantic Records. Isso culminou com um show no
Atlanta's Music Midtown Festival, em Maio de 2001, onde mais de 60 mil pessoas assistiram, levando à edição de "
Beyond Good and Evil".
O
single para promover o álbum, "
Rise", que alcançou a posição #41 nos
EUA e #2 nos Tops de rock
mainstream, deixou de tocar nas rádios uma semana após o lançamento do álbum. As vendas decepcionantes, críticas e a fraca assistência na tournée que se seguiu, e novamente em 2002 Astbury deixou os
The Cult, quando recebeu uma oferta para cantar com os
Doors.
No início de 2006, Duffy gravou um álbum de estreia com sua nova banda,
Circus Diablo. O álbum foi gravado com Duffy tocando guitarra e o ex-Cult Billy Morrison como vocalista e baixista. O ex-vocalista de
The Almighty, Ricky Warwick, tocou guitarra ritmo no
CD. O ex-Cult, actual baterista de
Velvet Revolver,
Matt Sorum também tocou no disco e aparece como cortesia da RCA Records.