Moraes Moreira começou tocando
sanfona de doze baixos em festas de
São João e outros eventos de
Ituaçu, o "Portal da Chapada Diamantina". Na adolescência aprendeu a tocar
violão, enquanto fazia curso de
ciências em
Caculé,
Bahia. Mudou-se para Salvador e lá conheceu
Tom Zé, e também entrou em contacto com o
rock n' roll. Mais tarde, ao conhecer
Baby Consuelo,
Pepeu Gomes,
Paulinho Boca de Cantor e
Luiz Galvão, formou o conjunto
Novos Baianos, onde ficou de
1969 até
1975. Juntamente com Luiz Galvão, foi compositor de quase todas as canções do Grupo. O álbum
Acabou Chorare, lançado pela banda em 1972, foi considerado pela revista Roling Stone Brasil um dos 100 melhores álbuns da história da música brasileira. Moraes Moreira possui 40 discos gravados, entre Novos Baianos, Trio Elétrico Dodô e Osmar e ainda dois discos em parceria com o guitarrista Pepeu Gomes. Moraes se enquadra entre um dos mais versáteis compositores do Brasil, misturando ritmos como frevo, baião, rock, samba, choro e até mesmo música erudita.
Saiu para uma carreira a solo no ano de 1975, e desde então já lançou mais de 20 discos. Na sua carreira a solo, destacou-se como o primeiro cantor de trio elétrico, cantando no Trio de
Dodô e Osmar, e lançou diversos sucessos de músicas de Carnaval, no que se convencionou chamar de "frevo trieletrizado". Alguns dos sucessos dessa fase são "Pombo Correio", "Vassourinha Elétrica" e "Bloco do Prazer", dentre outras. Durante os anos 80 se afastou um pouco do Carnaval baiano, devido a comercialização do Carnaval baiano para a indústria do turismo. Em 1994 gravou
O Brasil Tem Concerto, influenciado pela
música erudita, e no ano seguinte gravou o
Moraes Moreira Acústico MTV, mais tarde transformado em CD e DVD. Em 1997, gravou um disco carnavalesco em que comemora seus 50 anos,
50 carnavais e dois anos depois lança o disco
500 Sambas em homenagem aos 500 anos de descobrimento do Brasil. No ano 2000 lançou o disco
Bahião com H, tocando o
baião com seu característico sotaque baiano. Em 2003 completou sua trilogia que tinha como tema o Brasil, e incluía os três álbuns
Lá Vem o Brasil Descendo a Ladeira (1979) e
O Brasil Tem Concerto (1994) e
Meu Nome é Brasil (2003). Em 2005 lançou independentemente o surpreendente disco
De repente, misturando hip hop com repente nordestino e o swing característico de seu violão. Em 2008 Moraes lançou o livro
A história dos Novos Baianos e outros versos em que conta a história do grupo em literatura de cordel e curiosidades sobre as músicas de sua carreira solo, e sai em turnê pelo Brasil com o show homónimo, tocando os maiores sucessos de sua carreira e recitando trechos do livro, que em 2009 foi transformado em DVD e CD.
Em 2012 Moraes gravou o disco
A Revolta dos Ritmos, um disco com 12 composições inéditas dele. Paralelo ao novo CD Moraes viajou pelo Brasil, ao lado do seu filho
Davi Moraes, com uma turnê comemorando os 40 anos do disco
Acabou Chorare. A princípio seria apenas um show, mas devido ao grande sucesso a turnê foi criada e fez uma série de shows.