Começou sua carreira no teatro, desde cedo dedicando-se a papéis de malfeitores. Seu primeiro personagem foi Rumpelstiltskin, antagonista do conto homónimo dos irmãos Grimm. Lee ficou conhecido mundialmente interpretando o Conde Drácula, personagem que encarnou por diversas vezes pelos estúdios da britânica Hammer Film Productions. Foi vilão na franquia 007 interpretando o assassino Francisco Scaramanga. Atuou também na trilogia The Lord of the Rings e em dois filmes da trilogia O Hobbit interpretando o personagem Saruman. A sua carreira também foi marcada pelos filmes dirigidos por Tim Burton, como Sleepy Hollow, Charliue and the Chocolate Factory e Dark Shadows, e emprestou a voz a personagens de Corpse Bride e Tim Burton's Alice in Wonderland. Também atuou como Conde Dooku em Star Wars episódios II e III. A sua carreira foi bastante prolífica, com mais de 200 produções.
Em 2009, obteve o título de Cavaleiro Real. Além disso narrou vários álbuns da banda Rhapsody of Fire. Era ligado a PETA, entidade que luta pelos direitos dos animais.
Christopher Lee também foi voluntário em apoio ao exército finlandês durante a Guerra de Inverno contra a União Soviética, entre os anos 1939 e 1940.
Era casado com a ex-atriz e modelo dinamarquesa Gitte Lee, com quem teve uma filha, chamada Christina Erika Lee.
Lee morreu no dia 7 de junho de 2015, aos 93 anos de idade no hospital Chelsea e Westminster, em Londres, onde estava internado por problemas de insuficiência cardíaca e respiratória.